• “Xây dựng mô hình tầm soát người mang mở rộng ở phụ nữ Việt Nam bằng kỹ thuật giải trình tự thế hệ mới”, Sở KHCN TP.HCM tài trợ (2020-2022), hợp tác với ĐH Y Dược TP.HCM và Khoa Y, ĐHQG TP.HCM.

​

• “Nghiên cứu ứng dụng giải trình tự gene để phát hiện các đột biến kháng thuốc kháng sinh của vi khuẩn H. pylori”, hợp tác với CS2, BV ĐHYD TP.HCM (2020-2022).

​

• “Giá trị chẩn đoán của qui trình real-time PCR cải tiến phát hiện nhanh Streptococcus nhóm B ở thai phụ đủ tháng tại cơ sở 2, bệnh viện Đại học Y dược TP. Hồ Chí Minh”, hợp tác với CS2, BV ĐHYD TP.HCM (2020-2022).

​

• ”Nghiên cứu thành phần vi sinh trong đất canh tác bằng kỹ thuật metagenomics”, hợp tác với ĐH Cần Thơ (2020).

​

• “Nghiên cứu cơ chế gây bất ổn định bộ gene tế bào chủ dẫn đến ung thư dạ dày của vi khuẩn Helicobacter pylori phân lập tại Việt Nam“, tổ chức NAFOSTED tài trợ (2019-2021), hợp tác với BM Di truyền, Trường ĐH KHTN TP.HCM. 

​

• “Xác định các biến thể trên các gene liên quan đến bệnh cơ tim giãn nở ở bệnh nhân Việt Nam bằng kỹ thuật giải trình tự DNA thế hệ mới”, Sở KHCN TP.HCM tài trợ (2018-2020), hợp tác với Viện Tim TP.HCM, BV Tim Tâm Đức và Khoa Y, ĐHQG TP.HCM.

​

• “Xác định các biến thể trên các gene liên quan đến bệnh cơ tim phì đại bằng kỹ thuật NGS”, hợp tác với BV Tim Tâm Đức (2015-2017).

​

• Giải trình tự bộ gene và phân tích đặc điểm các gene kháng kháng sinh của Helicobacter pylori, Salmonella, Staphylococcus sp

​

• Giải trình tự và lắp ráp bộ gene hoàn chỉnh của Helicobacter pylori bằng cách kết hợp công nghệ giải đoạn đọc ngắn Illumina và đoạn đọc dài Nanopore

​

• Định danh vi khuẩn gây bệnh xơ đen trên mít siêu sớm tại Hậu Giang bằng Shallow WGS

​

• Giải trình tự DNA bộ gene của các vi khuẩn Pseudomonas, Bacillus, Paenibacillus,…

​

• Giải trình tự bộ gene của thực khuẩn thể (Bacteriophage), African swine fever virus,...

​

• Giải trình tự bộ gene của nấm Streptomyces,...

​

• Giải trình tự và lắp ráp DNA ty thể của cá

​

• Khảo sát thành phần vi sinh trong pin nhiên liệu vi sinh (MFC) sử dụng trong đánh giá hiệu quả xử lý nước thải bằng 16S metagenomics

​

• Xác định tác nhân gây bệnh ở phân mèo bệnh chưa rõ nguyên nhân bằng shotgun metagenomics

​

• Nghiên cứu thành phần vi sinh vật trong ruột tôm, cá, nước ao nuôi và bùn ao bằng 16S metagenomics, shotgun metagenomics bằng cả công nghệ giải Illumina và Nanopore

​

• Phân tích thành phần vi khuẩn trong mẫu sữa từ bò bệnh viêm vú bằng shotgun metagenomics

​

• Phân tích độ đa dạng vi sinh vật đất ở mô hình thâm canh lúa và luân canh lúa - tôm ở Sóc Trăng bằng 16S/shotgun metagenomics

​

• Khảo sát thành phần vi khuẩn nội cộng sinh trong rễ cây bằng 16S metagenomics