GIẢI TRÌNH TỰ OXFORD NANOPORE
Giải trình tự (GTT) Oxford Nanopore Technologies (ONT) cho phép giải những trình tự dài (long read) với thiết bị nhỏ gọn, linh hoạt, và thời gian giải nhanh. Công nghệ ONT có thể giải trình tự những vùng DNA lặp lại, do đó là một công cụ tiềm năng trong lắp ráp bộ gene hoàn chỉnh. Không chỉ vậy, thiết bị ONT có kích thước nhỏ gọn, và có thể GTT trực tiếp (không phụ thuộc vào PCR). GTT ONT có thể được xem là giải pháp tiết kiệm, nhanh chóng, linh động, phù hợp với nhiều mục tiêu nghiên cứu.
CÁC ỨNG DỤNG
Giải trình tự những đoạn dài giúp cho việc lắp ráp de novo được dễ dàng và chính xác hơn.
Xác định nhanh chóng sự hiện diện vi sinh vật trong mẫu môi trường.
Các ứng dụng khác theo yêu cầu
QUÝ KHÁCH SẼ NHẬN ĐƯỢC
Tùy thuộc vào yêu cầu cụ thể, quý khách sẽ nhận được những kết quả phân tích cũng như dịch vụ khác nhau. Dưới đây là một số kết quả hoặc dịch vụ quý khách có thể nhận được:
-
Kết quả phân tích lắp ráp các đoạn trình tự dài.
-
Kết quả phân tích thành phần, tỷ lệ các loại vi sinh, sự hiện diện gene chức năng nếu thực hiện cách tiếp cận metagenomics.
-
Báo cáo tóm tắt phương pháp, quy trình thực hiện.
-
Các kết quả phân tích khác theo yêu cầu khách hàng.
-
Tư vấn quy trình chuẩn bị mẫu, kết quả và tham gia công bố kết quả nếu khách hàng có yêu cầu.
QUY TRÌNH CHUNG
1. Nhận yêu cầu và tư vấn
2. Thu, nhận mẫu
3. Tách chiết DNA/RNA
4. Chuẩn bị thư viện
5. Giải trình tự
6. Phân tích dữ liệu
7. Trả kết quả và tư vấn
CÁC ĐỀ TÀI ĐÃ THỰC HIỆN
PHÂN TÍCH THÀNH PHẦN VI SINH TRONG NƯỚC AO TÔM TẠI NINH THUẬN BẰNG NANOPORE
Thành phần vi sinh nước ao tôm: 92% là vi khuẩn, 7% eukaryote, <1% là vi khuẩn cổ và virus, đặc biệt có sự hiện diện của WSSV phát hiện 0.01%, (Ct = 33); Vibrio parahaemolyticus: 0.03%. Nghiên cứu cũng xác định sự hiện diện của 1 số gene kháng kháng sinh nhóm tetracyline, beta lactam, sulfonamide, aminoglycoside..
