top of page
Tìm kiếm

HƯỚNG DẪN CHUẨN BỊ MẪU WGS

  • 11 thg 7
  • 12 phút đọc

Bảng hướng dẫn này cung cấp các thông tin về yêu cầu mẫu, hướng dẫn chuẩn bị mẫu và một số câu hỏi thường gặp khi thực hiện các dịch vụ giải trình tự toàn bộ bộ gene (WGS) ở KTest.


TUYÊN BỐ MIỄN TRỪ TRÁCH NHIỆM: Các yêu cầu được trình bày trong các trang tiếp theo nhằm đảm bảo mang lại kết quả tốt nhất có thể, đồng thời duy trì các tiêu chuẩn về chất lượng và hiệu suất của KTest. Những mẫu không đạt điều kiện tối ưu vẫn có thể được chấp nhận, nhưng có thể không đủ điều kiện để đáp ứng các tiêu chuẩn cam kết bàn giao. Ngay cả khi tất cả các điều kiện đã được đáp ứng, một số loại mẫu hoặc tình trạng cụ thể của mẫu vẫn có thể ảnh hưởng đến tỷ lệ thành công do những yếu tố nằm ngoài tầm kiểm soát của chúng tôi.

Trường hợp mẫu không đủ điều kiện yêu cầu, Quý khách vui lòng thảo luận với bộ phận Chăm sóc khách hàng (CSKH) của KTest để chọn phương án tốt nhất và chấp nhận rủi ro nhất định.

Nếu có bất kỳ câu hỏi nào, vui lòng liên hệ bộ phận CSKH của KTest.

MỤC LỤC

Câu 1. Thông tin địa chỉ, thời gian nhận mẫu

Câu 2. KTest sẽ HỦY MẪU khi nào ?

Câu 3. Quy trình dịch vụ gồm những bước nào ?

Câu 4. Tôi có thể yêu cầu phân tích mẫu có chứa tác nhân gây nhiễm hay không ?

Câu 5. Hướng dẫn chuẩn bị mẫu DNA - dịch vụ giải trình tự WGS đoạn ngắn

Câu 6. Hướng dẫn chuẩn bị mẫu - dịch vụ WGS đoạn ngắn vi khuẩn / nấm

Câu 7. Hướng dẫn chuẩn bị mẫu - dịch vụ WGS đoạn ngắn phage/virus

Câu 8. Hướng dẫn chuẩn bị mẫu - dịch vụ WGS đoạn ngắn/dài lục lạp

Câu 9. Hướng dẫn chuẩn bị mẫu - dịch vụ WGS đoạn ngắn/dài ty thể động vật

Câu 10. Hướng dẫn chuẩn bị mẫu DNA - dịch vụ WGS đoạn dài

Câu 11. Hướng dẫn chuẩn bị mẫu vi khuẩn/nấm - dịch vụ WGS đoạn dài

Câu 12. Tôi có thể lấy lại mẫu dư sau dịch vụ không ?

Câu 13. KTest có dịch vụ thu gom mẫu hay đơn vị vận chuyển mẫu không ?



  • Thời gian nhận mẫu: Thứ 2 đến thứ 6, 7h30 - 17h00;

  • Địa chỉ gửi mẫu đến: Số 17, Đường số 4, KDC Gia Hòa, Ấp 66, Xã Bình Hưng, Tp. Hồ Chí Minh.

  • Số điện thoại: 028 221 332 54 – 091 50 332 54 (zalo)

  • Đính kèm (bắt buộc): Phiếu yêu cầu dịch vụ, thông báo trước cho KTest trước khi gửi mẫu. Liên hệ bộ phận CSKH của KTest để được tư vấn và cung cấp mẫu phiếu yêu cầu dịch vụ.

KTest sẽ hủy mẫu trong các trường hợp sau:

  1. Mẫu gửi đến KTest không có thông tin xác định danh tính (thiếu phiếu yêu cầu dịch vụ, không ghi tên, thông tin liên hệ người gửi).

  2. Mẫu gửi đến ngoài thời gian làm việc của KTest có thể bị trả về.

  3. Sau tối đa 2 tuần kể từ ngày nhận mẫu KTest liên hệ khách hàng xác nhận dịch vụ và đặt cọc mà khách hàng không phải hồi/xác nhận.

  4. Sau 30 ngày kể từ ngày trả kết quả

  5. Các mẫu có dấu hiệu nguy hiểm (bể vỡ, rò rĩ, có dấu hiệu lây nhiễm, độc hại,...) mà không được khách hàng báo trước

  6. Theo thỏa thuận với khách hàng

Quy trình dịch vụ của KTest gồm 9 bước như mô tả

Quy trình dịch vụ tại KTest

KTest có có thể xử lý một số nền mẫu chứa tác nhân gây nhiễm ở mức độ an toàn sinh học cấp 2. KTest không nhận mẫu bệnh phẩm chứa vi khuẩn, virus còn sống và được phân loại an toàn sinh học >2.

Nếu đối tượng cần phân tích là vi sinh vật gây bệnh, xin điền rõ thông tin vào Phiếu yêu cầu dịch vụ.

Dịch vụ áp dụng

Loại mẫu

Yêu cầu mẫu

Hướng dẫn đóng gói – vận chuyển

Giải trình tự (GTT) đoạn ngắn cho các dịch vụ WGS vi khuẩn, phage, virus, nấm, lục lạp, ty thể, plasmid, sản phẩm PCR,…

DNA/cDNA/plasmid/sản phẩm PCR

- Nồng độ tối thiểu: 10 ng/µL; Thể tích mẫu tối thiểu: 50 µL; OD260/280 = 1.7-2.0; Cảm quan: mẫu không cặn, không nhớt, không đục, không màu. Gửi kèm 10 µL dung dịch hòa tan DNA.

 - Mẫu bảo quản trong điều kiện đông (-20oC), vận chuyển trong điều kiện mát đến đông.

 - Nếu sản phẩm PCR, ghi rõ kích thước sản phẩm (kèm hình điện di nếu có trong phiếu YCDV).

Lưu ý: KTest sẽ QC lại mẫu trên hệ thống đo Qubit, đối với các mẫu không tinh sạch (nhiễm RNA, protein,…), có thể có sự chênh lệch lớn.  

 - Vật chứa: Eppendorf/tube 1.5 hoặc 2mL sạch. Ghi rõ tên mẫu trên thân và nắp, tên trùng khớp với tên trên phiếu YCDV.

 - Đậy kín nắp và quấn màng parafilm (nếu có) quanh miệng ống Eppendorf chứa mẫu. Để đảm bảo an toàn trong quá trình vận chuyển, nên đặt các ống Eppendorf vào trong ống Falcon 50mL và chèn thêm giấy hoặc xốp để cố định. Cuối cùng, đóng gói mẫu vào thùng xốp kèm theo đá gel hoặc đá khô để bảo quản.

 - Mẫu cần được vận chuyển hỏa tốc đến KTest trong 1-3 ngày, không nên quá 5 ngày. 

  • Đối với mẫu DNA đã tách chiết: xem ở câu 5

  • Đối với mẫu khuẩn lạc vi khuẩn, nấm nuôi cấy trên đĩa/ống thạch agar:

Dịch vụ áp dụng

Yêu cầu mẫu

Hướng dẫn đóng gói – vận chuyển

GTT đoạn ngắn bộ gene vi khuẩn/nấm

 

KTest không nhận mẫu quả thể/bào tử nấm; không nhận các vi khuẩn còn sống và được phân loại An toàn sinh học >2

- Khuẩn lạc đã được làm thuần, mới nuôi cấy, có >10 khuẩn lạc trên đĩa, nếu khuẩn lạc nhỏ >20 khuẩn lạc.

- Nếu là đĩa nấm sợi, sợi nấm bao phủ ít nhất 2/3 đĩa

- Nếu đĩa petri có nhiều loại khuẩn lạc, KH cần khoanh ít nhất 10 khuẩn lạc cần lấy. Nếu KH không khoanh rõ, KTest sẽ lấy khuẩn lạc ngẫu nhiên trên đĩa.

- Mẫu được bảo quản và vận chuyển ở điều kiện mát (4-15oC), không đông đá.

 - Ghi rõ tên mẫu trên đĩa, tên trùng khớp với tên trên phiếu YCDV.

 - Quấn parafilm kỹ quanh đĩa. Để đảm bảo an toàn trong quá trình vận chuyển, nên đặt các đĩa trong thùng xốp có chèn thêm giấy hoặc xốp để cố định. Tránh cho các đĩa tiếp xúc với nhau để hạn chế đĩa vỡ khi cọ vào nhau. Trong thùng cần kèm theo đá gel để bảo quản.

 - Mẫu cần được vận chuyển hỏa tốc đến KTest trong 1-3 ngày, không nên quá 5 ngày.

  • Đối với mẫu canh khuẩn/dịch nuôi cấy/sinh khối:

Dịch vụ áp dụng

Yêu cầu mẫu

Hướng dẫn đóng gói – vận chuyển

GTT đoạn ngắn bộ gene vi khuẩn/nấm

 

KTest không nhận mẫu quả thể/bào tử nấm; không nhận các vi khuẩn còn sống và được phân loại an toàn sinh học>2

- Sinh khối lỏng/canh khuẩn: 3-5mL, nuôi cấy qua đêm từ khuẩn lạc thuần. Dịch đục, không xuất hiện màu/cặn lạ/dấu hiệu nhiễm. Mẫu được bảo quản và vận chuyển ở điều kiện mát (4-15oC), không đông đá.

 - Sinh khối (đã ly tâm thu cặn): ít nhất 3-5 eppendorf, ly tâm từ 1mL sinh khối/eppendorf, rửa lại 1-2 lần bằng PBS1X hoặc NaCl 0,9%. Mẫu cần để đông (<0oC, tốt nhất là -20oC đến -80oC) trước khi gửi, sau đó vận chuyển trong đá khô (ưu tiên) hoặc đá gel.

 - Vật chứa: Falcon 15mL hoặc Eppendorf/tube 1.5 hoặc 2mL sạch. Ghi rõ tên mẫu trên thân và nắp, tên trùng khớp với tên trên phiếu YCDV.

 - Quấn parafilm kỹ quanh nắp. Để đảm bảo an toàn trong quá trình vận chuyển, nên đặt các ống trong thùng xốp có chèn thêm giấy hoặc xốp để cố định. Trong thùng cần kèm theo đá gel để bảo quản.

 - Mẫu cần được vận chuyển hỏa tốc đến KTest trong 1-3 ngày, không nên quá 5 ngày.

  • Đối với mẫu DNA/cDNA: xem ở câu 5

  • Đối mẫu các mẫu phage/virus đã tinh sạch, vaccine,...

Dịch vụ áp dụng

Yêu cầu mẫu

Hướng dẫn đóng gói – vận chuyển

GTT đoạn ngắn bộ gene virus/phage

 

KTest không nhận mẫu virus còn sống và được phân loại an toàn sinh học >2

 - Thể tích 3-5mL trong môi trường nuôi cấy hoặc dịch bảo quản.

 - Mẫu được bảo quản và vận chuyển ở điều kiện mát (4-15oC).

 

Lưu ý: KTest không thể đánh giá được lượng tế bào của phage/virus trong mẫu nên chỉ thực hiện theo quy trình thường quy, không đảm bảo tách chiết được.

 - Vật chứa: Falcon 15mL hoặc Eppendorf/tube 1.5 hoặc 2mL sạch. Ghi rõ tên mẫu trên thân và nắp, tên trùng khớp với tên trên phiếu YCDV. Ghi rõ tên vật chủ trong phiếu YCDV.

 - Quấn parafilm kỹ quanh nắp. Để đảm bảo an toàn trong quá trình vận chuyển, nên đặt các ống trong thùng xốp có chèn thêm giấy hoặc xốp để cố định. Trong thùng cần kèm theo đá gel để bảo quản.

 - Mẫu cần được vận chuyển hỏa tốc đến KTest trong 1-3 ngày, không nên quá 5 ngày.

  • Đối với các mẫu bệnh phẩm, mô, máu, serum, tăm bông, tế bào....

Dịch vụ áp dụng

Yêu cầu mẫu

Hướng dẫn đóng gói – vận chuyển

GTT đoạn ngắn bộ gene virus


KTest không nhận mẫu virus còn sống và được phân loại an toàn sinh học >2

- Lượng mẫu: dạng lỏng: 2-3mL; dạng mô 1-3 g; 3-5 que phết/tăm bông.

 - Mẫu cần để đông (<0oC, tốt nhất là -20oC đến -80oC) trước khi gửi, sau đó vận chuyển trong đá khô (ưu tiên) hoặc đá gel. Hoặc tùy theo khuyến cáo của dung dịch bảo quản sử dụng.   

 - Nếu mẫu được bảo quản trong các dung dịch bảo quản (DNA/RNA shield, RNAlater,…), vui lòng thông báo cho KTest loại dung dịch sử dụng để có xử lý phù hợp.

Lưu ý: KTest không thể đánh giá được lượng tế bào của virus trong mẫu nên chỉ thực hiện theo quy trình thường quy, không đảm bảo tách chiết được.

- Vật chứa: Falcon 15mL hoặc Eppendorf/tube 1.5 hoặc 2mL sạch hoặc các ống máu chuyên dụng. Ghi rõ tên mẫu trên thân và nắp, tên trùng khớp với tên trên phiếu YCDV. Ghi rõ tên vật chủ trong phiếu YCDV.

 - Quấn parafilm kỹ quanh nắp. Để đảm bảo an toàn trong quá trình vận chuyển, nên đặt các ống trong thùng xốp có chèn thêm giấy hoặc xốp để cố định. Trong thùng cần kèm theo đá gel để bảo quản.

 - Mẫu cần được vận chuyển hỏa tốc đến KTest trong 1-3 ngày, không nên quá 5 ngày.

  • Đối với mẫu DNA: xem câu 5

  • Đối với mẫu thực vật, rong, tảo (nhân thật),...

Dịch vụ áp dụng

Yêu cầu mẫu

Hướng dẫn đóng gói – vận chuyển

GTT đoạn ngắn hoặc dài lục lạp

 

 

 - Lượng mẫu: tối thiểu 10 g lá/rong/tảo non, tươi. Nếu mẫu có khả năng có vi sinh bám trên bề mặt (đặc biệt là rong, tảo), khách cần làm sạch bằng Javel/cồn và rửa lại bằng nước cất.

 - Mẫu được bảo quản và vận chuyển ở điều kiện mát (4-15oC), không đông đá.

 

Lưu ý: các mẫu khô, KTest có thể nhận thử theo quy trình thường quy, tuy nhiên chất lượng mẫu có thể rất kém. 

 - Vật chứa: túi zip hoặc falcon 50mL sạch. Ngoài ra, đối với mẫu lá cây có thể bọc bên ngoài lá 1 lớp giấy mềm. Do khi vận chuyển xa và trong quá trình lưu trữ mẫu lá có khả năng bị dập, các dịch này của lá có khả năng gây phân hủy lá nhiều hơn. Ghi rõ tên mẫu trên túi/ống, tên trùng khớp với tên trên phiếu YCDV. - Để đảm bảo an toàn trong quá trình vận chuyển, nên đặt các mẫu/ống trong thùng xốp có chèn thêm giấy hoặc xốp để cố định. Trong thùng cần kèm theo đá gel để bảo quản.

 - Mẫu cần được vận chuyển hỏa tốc đến KTest trong 1-3 ngày, không nên quá 5 ngày.

  • Đối với mẫu DNA: xem ở câu 5

  • Đối với mẫu mô động vật (cơ, vây cá,...):

Dịch vụ áp dụng

Yêu cầu mẫu

Hướng dẫn đóng gói – vận chuyển

GTT đoạn ngắn hoặc dài ty thể

 - Loại mẫu: ưu tiên mẫu mô cơ (thường có tỷ lệ ty thể cao) và dễ xử lý. 

 - Lượng mẫu: tối thiểu 5-10 g. Mẫu có thể bảo quản ngập trong ethanol (sinh học phân tử) 70-95%, hoặc các dung dịch thương mại như (DNA/RNA shield, RNAlater). Vui lòng thông báo cho KTest loại dung dịch sử dụng để xử lý mẫu phù hợp.

- Mẫu được bảo quản và vận chuyển ở điều kiện mát (4-15oC), không đông đá, hoặc tùy theo khuyến cáo của dung dịch bảo quản sử dụng.   

 - Vật chứa: túi tube hoặc falcon 50mL hoặc chai/lọ sạch. Ghi rõ tên mẫu trên ống, tên trùng khớp với tên trên phiếu YCDV.

 - Để đảm bảo an toàn trong quá trình vận chuyển, nên đặt các mẫu/ống trong thùng xốp có chèn thêm giấy hoặc xốp để cố định. Trong thùng cần kèm theo đá gel để bảo quản.

 - Mẫu cần được vận chuyển hỏa tốc đến KTest trong 1-3 ngày, không nên quá 5 ngày.

Dịch vụ áp dụng

Yêu cầu mẫu

Hướng dẫn đóng gói – vận chuyển

GTT đoạn dài bộ gene vi khuẩn/nấm/lục lạp/ty thể/sản phẩm long-range PCR.

- Nồng độ tối thiểu: 100 ng/µL; Thể tích mẫu tối thiểu: 50 µL; OD260/280 = 1.7-2.0; Nguyên vẹn: Kết quả điện di trên gel agarose 1%, kích thước trên 10kb, không có vệt đứt gãy; Cảm quan: mẫu không cặn, không nhớt, không đục, không màu.

 - Mẫu bảo quản trong điều kiện đông (-20oC), vận chuyển trong điều kiện mát đến đông.

- Gửi kèm 10 µL dung dịch hòa tan DNA

Lưu ý: KTest khuyến cáo Quý khách tách chiết với kit High-molecular weight để có kết quả tách chiết tốt hơn về nồng độ và kích thước. KTest sẽ QC lại mẫu trên hệ thống đo Qubit, đối với các mẫu không tinh sạch (nhiễm RNA, protein,…), có thể có sự chênh lệch lớn.

 - Vật chứa: Eppendorf/tube 1.5 hoặc 2mL sạch. Ghi rõ tên mẫu trên thân và nắp, tên trùng khớp với tên trên phiếu YCDV.

 - Đậy kín nắp và quấn màng parafilm (nếu có) quanh miệng ống Eppendorf chứa mẫu. Để đảm bảo an toàn trong quá trình vận chuyển, nên đặt các ống Eppendorf vào trong ống Falcon 50mL hoặc để mỗi tube vào túi zip riêng biệt và chèn thêm giấy hoặc xốp để cố định. Cuối cùng, đóng gói mẫu vào thùng xốp kèm theo đá gel hoặc đá khô để bảo quản.- Mẫu cần được vận chuyển hỏa tốc đến KTest trong 1-3 ngày, không nên quá 5 ngày.

  • Đối với mẫu DNA: xem ở câu 10

  • Đối với mẫu vi khuẩn/nấm nuôi cấy: yêu cầu sinh khối/canh khuẩn/dịch nuôi cấy

Dịch vụ áp dụng

Yêu cầu mẫu

Hướng dẫn đóng gói – vận chuyển

GTT đoạn dài bộ gene vi khuẩn/nấm

 

KTest không nhận mẫu quả thể/bào tử nấm; không nhận các vi khuẩn còn sống và được phân loại an toàn sinh học >2

- Sinh khối lỏng/canh khuẩn: 10-20mL, nuôi cấy qua đêm từ khuẩn lạc thuần. Dịch đục, không xuất hiện màu/cặn lạ/dấu hiệu nhiễm. Mẫu được bảo quản và vận chuyển ở điều kiện mát (4-15oC), không đông đá.

 - Sinh khối (đã ly tâm thu cặn): ít nhất 5-10 eppendorf, ly tâm từ 2mL sinh khối/Eppendorf, rửa lại 1-2 lần bằng PBS1X hoặc NaCl0,9%. Mẫu cần để đông (<0oC, tốt nhất là -20oC đến -80oC) trước khi gửi, sau đó vận chuyển trong đá khô (ưu tiên) hoặc đá gel.

 Lưu ý: các mẫu đĩa khuẩn lạc (5-10 đĩa tùy lượng khuẩn lạc), KTest có thể nhận thử theo quy trình thường quy, tuy nhiên chất lượng mẫu có thể kém.

 - Vật chứa: Falcon 15-50mL hoặc Eppendorf/tube 1.5 hoặc 2mL sạch. Ghi rõ tên mẫu trên thân và nắp, tên trùng khớp với tên trên phiếu YCDV.

 - Quấn parafilm kỹ quanh nắp. Để đảm bảo an toàn trong quá trình vận chuyển, nên đặt các ống trong thùng xốp có chèn thêm giấy hoặc xốp để cố định. Trong thùng cần kèm theo đá gel để bảo quản.

 - Mẫu cần được vận chuyển hỏa tốc đến KTest trong 1-3 ngày, không nên quá 5 ngày.

Có, nếu mẫu còn dư sau thí nghiệm và trong thời hạn lưu mẫu. Quý khách vui lòng ghi rõ trong phiếu yêu cầu dịch vụ hoặc thông báo cho bộ phận CSKH khi có yêu cầu. Nếu nhận lại mẫu, Quý khách vui lòng thanh toán phí đóng gói và vận chuyển mẫu.

Rất tiếc, KTest hiện chỉ nhận mẫu tại công ty hoặc mẫu được gửi đến công ty. Quý khách có thể sử dụng các dịch vụ vận chuyển nhanh/hỏa tốc như ViettelPost, Grab, Giao hàng nhanh,...



Bình luận

KTest logo

Số 17, Đường số 4, KDC Gia Hòa, Ấp 66, Xã Bình Hưng, Tp. Hồ Chí Minh
Info@KTest.vn
(+84) 028.2213.3254

Hãy kết nối với KTest

  • Email
  • Zalo
  • Facebook

Giới thiệu
Dịch vụ 
Lĩnh vực

Dự án đã thực hiện
Tin tức và sự kiện

ISO 17025

© 2025 Bản quyền thuộc về KTest

Hãy để lại lời nhắn hoặc thắc mắc để được tư vấn thêm!

KTest sẽ liên hệ lại sớm nhất có thể.

C&aacute;m ơn qu&yacute; kh&aacute;ch!

bottom of page